Boksera mēteļa krāsas ir salīdzinoši vienkāršas. Visiem tīršķirnes bokseriem uz purnas ir melna maska, lai gan to var daļēji vai pilnībā aizsegt balti marķējumi.
Stirnēns
Fawn ir vienkrāsains, sākot no gaiši iedeguma līdz tumši sarkanīgi nokrāsai. Tumšākās ikrus dažreiz sauc par sarkankoka vai briežu sarkanā krāsā - patiesībā dažās valstīs krāsas apzīmēšanai fawn vietā lieto terminu "sarkans". Tumšāku ikru mētelī var būt iejaukti daži melni matiņi, vai arī izliektajiem matiem var būt melna krāsa. Tas mēteļa daļās, īpaši ausu malās, var radīt mazus melnus laukumus vai "iesmērēšanos".
Brindle
Otra krāsa AKC boksera standartā ir brindle, kas ir melna svītraina uz dzeltenbrūnā pamata slāņa. Tehniski runājot, visi bokseri ir gaiši - brindle ir marķējuma raksts, nevis faktiska krāsa. Tomēr ir daudz vieglāk saukt brindle par krāsu, un šī konvencija ir labi strādājusi gadsimtu. Brindle bokseru ķermenim var būt tikai dažas svītras - to dažkārt jokojot sauc par "frindles". Spektra otrajā galā svītras var būt pietiekami smagas, lai, kā aprakstīts Amerikas Audzētavu kluba standartā, "radītu reversās brindlinga izskatu", jo izskatās, ka izliektas svītras ir krāsotas uz melna ķermeņa. Zaļajai pamatkrāsai vienmēr jābūt redzamai, pat ja tā atrodas tikai dažās nelielās ķermeņa daļās.
Balta
Baltais ir vēl viens marķējuma raksts - ģenētiski visi baltie bokseri ir vai nu pelēki, vai arī dzelteni zem baltās krāsas krāsas. Balto marķējumu daudzums var ievērojami atšķirties - no viena līdz pat 100 procentiem. Bokseri ar baltiem marķējumiem, kas sedz vienu trešdaļu vai mazāk ķermeņa, sauc par "bezgaumīgiem". Šie marķējumi parasti atrodas uz kājām, kājām, kakla un sejas. Kad ķermeņa lielākā daļa ir balta, suni sauc par balto bokseri - tas atkal nav tehniski pareizs, bet tā ir vieglāk. Baltajiem bokseriem bieži ir krāsu plankumi, parasti uz ausīm vai ap acīm un dažreiz uz muguras. AKC nodrošina reģistrācijas kodus gan baltiem marķējumiem, gan baltiem kā krāsām.
Baltie bokseri nav reti vai neparasti; Lai gan oficiālā statistika nav saglabāta, pamatoti tiek lēsts, ka apmēram 20 procenti no visiem bokseriem ir balti. Suņi ar baltu pārklājumu, kas sedz vairāk nekā vienu trešdaļu ķermeņa, tiek šķirti no suņu izstādēm saskaņā ar šķirnes standartu, un vecāku kluba ētikas kodekss tiem ir aizliegts audzēt. Baltie bokseri var piedalīties paklausībā, veiklībā, ganāmpulkā, sacensībās, rallijā un citās aktivitātēs.
Ģenētika
Boksera mēteļa krāsu ģenētika ir vienkārša. Brindle ir dominējoša, lai izbalētu, tas nozīmē, ka suns, kuram ir pat viens brindle gēns, būs brindle. Modifikatori, nevis brindle gēns, nosaka brindle svītru daudzumu uz boksera - sunim ar diviem brindle gēniem var būt vai nav vairāk svītru nekā sunim ar vienu brindle gēnu. Baltas krāsas marķējumus izraisa galējais piebalda gēns, un tie ir kopīgi dominējoši. Suns ar vienu baltu gēnu būs bezgaumīgs, savukārt suns ar diviem baltiem gēniem būs galvenokārt vai pilnīgi balts.
Melns
Arvien vairāk selekcionāru pārdod "melnos bokserus", kurus bieži tirgo kā "retus" un pārdod par augstām cenām. Diemžēl melns mētelis bokserim ir ģenētiski neiespējams, un AKC nenorāda krāsu kodu melnai. Vienīgais veids, kā iegūt melnu mēteli, ir šķērsot bokseri ar citu šķirni. Tā kā melnā krāsa ir dominējoša ķipariem un dzelteniem, to nevar "paslēpt" paaudzēm; ja sunim ir viens gēns melnā kažoka krāsai, tam būs melns mētelis.
